Добрый день!

Это не совсем риэлторский вопрос, но на мой взгляд, оспорить доначисление за ЖКХ вы не сможете. Оснований для этого не видно. Проверку правильности начисления вы не делали, об ошибках в Жилищник не сообщали. Непонятно, почему суд должен встать на вашу сторону.

Проконсультируйтесь с юристом. Но скорее всего, задолженность и пени вам придётся погасить.

Вы эти деньги должны,т.к. не доплачивали за коммунальные услуги.А преднамеренно или по незнанию - это значения не имеет.В суд жилищник подаст, может уже подавал.Узнаете вы об этом или не узнаете - тоже значения не имеет.Срок давности на этот долг потом не действует.

Никто вас не обязан за ручку водить и рассказывать, что нужно делать. Не логично умершего человека снять с регистрации? Какого суда вы ждете? Чтоб вас обвинили в мошенничестве?

вы прождали два года и дождались начисления пеней, помимо суммы основного долга. и спрашиваете, подождать ли вам еще. ну подождите еще, может чего еще интересненькое произойдет с вашим долгом )))
"Паспорт ее забрали, документы все выдали о смерти, а это не сделали" - и не должны были, потому что это совершенно разные функции. представьте - вы вызвали мастера, чтобы он вам починил стиральную машинку, а после его ухода жалуетесь что он не заменил перегоревшую лампочку на кухне. логично? не очень. вот и здесь ровно такая же ситуация. оформление документов о смерти (изъятие паспорта и выдача взамен свидетельства о смерти против медицинского) - это процедура, никак не связанная с оплатой жкх. вот вам ничего и не сказали.
а что касается дальнейшего ожидания - ну ждите, пока вам ограничат выезд за границу и прочие поражения в правах организуют.
подать в суд самим - на кого, на мфц? а в чем будет заключаться содержание искового?